驾驶运输船是保障后勤和跨区域作战的关键，你需要掌握从建造到卸货的完整流程。运输船本身没有战斗力，主要功能是跨海运送部队和各类物资，比如步兵、轻型车辆、弹药、燃料和食物，但像坦克这样的重型装备通常无法上船，操作时需在港口界面选择船只并确认装载内容，注意别超过船的载重限制。规划航线时必须考虑安全，尽量绕开敌人海军和空军活跃的海域，利用群岛地形或复杂航线进行迂回，同时天气也影响航行，暴风雨会减速但有时能提供隐蔽。
获取运输船需要先在拥有港口的城市建造，这要求你的主城达到一定等级并在兵工厂研究相关科技。装载部队和物资时要根据战场需求决定优先级，比如前线急需的弹药和燃料应该优先装载，而运送部队时要考虑不同兵种占用的舱位空间。出发前务必检查船只的燃油储备是否充足，以防长途航行时因缺油被困海上，同时可以给运输船配备一些防御装备，比如防空炮或反潜设备，以应对突发情况。
航行过程中的保护是运输任务成败的核心，单独的运输船极易成为靶子。你必须为运输船队配置护航舰队，通常由驱逐舰和巡洋舰组成，它们能有效应对潜艇威胁和空中袭击。出发前最好派遣侦察机对航线进行侦查，摸清敌方舰队的动向，遭遇拦截时要及时调整路线或请求支援。为了降低风险，可以考虑选择在夜间或雾天出发，利用恶劣天气隐蔽行踪，多艘运输船执行任务时采用交替航行或分散航线的方式也能避免被一锅端。
最稳妥的方式是停靠在自己或盟友控制的港口，这会自动快速卸货。如果前线没有港口，则需要让船开到海岸边进行登陆，此时需派出登陆艇来回转运或让部队涉水登陆，这个过程耗时较长且船只静止不动非常危险。因此卸货前必须确保降落区域的绝对安全，最好先派兵肃清周边敌人并掌握制空权，护航舰队在卸货期间也要保持高度警戒。物资卸载也有顺序，通常优先卸下弹药和燃料等关键作战物资。
除了海上运输，游戏内还有更快速的空运方式，通过运输机可以紧急投送步兵和轻型装备，但载量小且航线需避开防空火力。将运输船的使用融入整体战略非常重要，比如在发动登陆战前，应同步或提前运输用于掩护的部队。与盟友协同组织联合护航或共享运输线路能大幅提升效率。后期可以通过科技研发升级运输船的载重量、航行速度和装甲，建立稳定的环形补给网络或设置中转站能实现更高效的阶梯式物资输送。
